在云南申请软件著作权，可以遵循以下步骤：
填表
访问中国版权保护中心的网站，填写计算机软件著作权登记的申请表。申请表填写完成后会生成受理号，需要打印并盖章或签字。
提交书面材料
准备以下材料并向中国版权保护中心提交：
盖章的申请表
申请人的主体资格证明资料（如身份证、营业执照等）
计算机软件源代码的前30页和后30页（如果不足60页，则全部提交），并在每页的左侧留出装订线，右上角打印或标注页号1—60。
软件用户手册、操作手册、设计说明书、使用说明书等任选一种。
受理
著作权登记文件初步审查通过后，版权保护中心会受理申请。根据目前的政策，国家是免收计算机软件著作权登记的费用的。
审查
版权保护中心会根据《计算机软件保护条例》和《计算机软件著作权登记办法》的规定进行审查，审查通过的，予以登记；不符合规定的，发放补正通知。
领取证书
审查通过后，大概需要30到60日的时间，就可以领取著作权登记证书。
建议
提前准备：提前准备好所有必要的材料，确保材料齐全、格式正确。
专业帮助：如果对申请流程或材料准备不熟悉，建议委托专业的知识产权律师代为办理，以提高登记成功率并减少补正材料的风险。
及时更新：关注中国版权保护中心的最新通知和更新，确保按照最新的要求和流程进行申请。