对付卖软件的公司，可以采取以下几种方法：
向相关行政部门投诉
可以向当地工商行政管理部门或著作权管理部门投诉，要求对销售盗版软件的公司进行查处。这些部门有权对销售盗版软件的公司进行罚款、没收假冒伪劣商品，甚至吊销营业执照。
通过法律途径维权
可以委托律师发出律师函，起诉销售盗版软件的公司。虽然律师函的效力有限，但在一些情况下可以起到警示作用。
如果情节严重，可以向法院提起诉讼，要求赔偿损失并追究其刑事责任。
利用电商平台投诉机制
如果是在电商平台（如淘宝、闲鱼等）发现销售盗版软件的行为，可以在平台内进行投诉，要求平台方下架侵权商品并封禁卖家账号。
组建维权团队
软件公司可以组建专门的维权团队，负责监控线上销售渠道，及时发现并处理侵权链接。这需要投入较多资源，但在长期内可以提高维权效率。
政府监管和公众教育
政府部门应加强对盗版软件市场的监管，加大打击力度，提高对侵权行为的惩罚力度。同时，加强对公众的知识产权保护教育，提高公众的版权意识。
技术手段的应用
通过独立软件审核机构的技术手段，监控软件市场，及时发现并处理盗版软件。此外，与正版软件厂商合作，加强软件版权保护，提高软件产品的安全性和稳定性。
合作与和解
在某些情况下，可以与卖盗版软件的公司进行协商，寻求和解，要求其停止侵权行为并赔偿损失。这种方式可能需要一定的谈判技巧和妥协。
综上所述，对付卖软件的公司需要综合运用法律、技术和市场手段，通过多管齐下的方式，才能有效打击盗版软件的销售行为，保护知识产权的合法权益。