太监的手术过程非常残忍， 主要是切除男性的外生殖器，包括阴茎和睾丸。手术的具体步骤如下：
割睾丸：
首先，在睾丸的球囊左右各横割开一个深口子，把筋络割断以便把睾丸挤出来。这个过程需要阉割者身子打挺，小肚子使劲往外鼓，用全身的力气把睾丸挤出来。刀子匠会在球囊的左右两边贴上片好的猪苦胆（起止血作用）。
割阴茎：
接下来，需要将阴茎和阴囊一起切断。手术时通常分两部进行：第一步是割睾丸，第二步是割阴茎。割阴茎时要求相当高的技术，如果割浅了会留有余势，将来里面的脆骨会往外鼓出，需要再割一次，称为“刷茬”。如果割深了，将来痊愈后会往里塌陷，形成坑状，解小便时呈扇面状，一辈子不方便。阴茎割除后，要插上一根大麦杆，然后把另一个猪苦胆劈开，呈蝴蝶状的敷在创口上。
这些手术步骤不仅极其痛苦，而且风险很高，可能导致死亡。因此，古代太监制度虽然得以存在，但其残酷性也是显而易见的。