《朝花夕拾》中的《藤野先生》主要 赞扬了日本学者藤野先生正直、热诚、认真负责，没有狭隘的民族偏见的高尚品质，抒发了作者对藤野先生真挚、深沉的怀念之情，并表述了作者当年弃医从文的思想变化和要同反动派斗争到底的决心。
文章记录作者在日本留学时期的学习生活，叙述了在仙台医专受日本学生歧视、侮辱和决定弃医从文的经过。作者突出地记述了日本老师藤野先生的严谨、正直、热诚、没有民族偏见的高尚品格，说“他的性格，在我的眼里和心里是伟大的，虽然他的姓名并不为许多人所知道”，表达了对藤野先生深情的怀念。
同时，这篇散文也回忆了作者在日本求学时期探索救国道路和思想转变的过程。为了祖国的前途和命运，作者毅然放弃了跟随生平最敬爱的老师——藤野先生学习医学，摈弃了科学救国的改良主义道路，决心同封建及帝国主义势力斗争到底。
藤野先生的形象是一位异国医学教授，因为表现出平等待人的态度，因为关心弱国子民的学业，他朴素而伟大的人格令人肃然起敬。