001集云霄飞车杀人事件：
黑衣组织—琴酒、伏特加出场，工藤新一喝下APTX4869变小，大幕拉开，柯南登场。
002集董事长千金绑架事件：
阿笠博士知道其身份，工藤新一化名为江户川柯南。
011集钢琴奏鸣曲月光杀人事件：
一个著名的钢琴家被杀，案件背后隐藏着复杂的秘密。
043集江户川柯南诱拐事件：
柯南的父母得知他变小后，开始寻找他。
048集外交官杀人事件：
涉及多国间谍和外交官的复杂案件。
076集柯南对怪盗基德：
柯南与怪盗基德的首次对决。
096集走投无路的名侦探：
柯南面临重大危机，但凭借智慧化解。
118集浪花连续杀人事件：
一系列连续杀人案件的调查。
129集来自黑暗组织的女子，大学教授杀人事件：
灰原哀登场，揭示更多关于黑衣组织的秘密。
162集飞天密室，工藤新一最初的事件：
柯南回到过去，解决新一的最初案件。
174集20年的杀意，新佛尼号连续杀人事件：
涉及20年前的未解之谜。
176集与黑暗组织的再会：
柯南再次与黑衣组织成员交锋。
539集谜一样的的乘客（前篇） 和 540集谜一样的的乘客（后篇）：
两个紧密相连的案件，情节扣人心弦。
584集同时进行的追踪（前篇）和 585集同时进行的追踪（后篇）：
涉及多个嫌疑人和紧张的剧情。
673集疑惑的咖喱（前篇）和 674集疑惑的咖喱（后篇）：
一个充满悬疑的案件。
732集同时进行的追踪（前集）和 733集同时进行的追踪（后集）：
继续讲述追踪嫌疑人的故事。
11-12集：
柯南唯一一次杀死人，诚实医生最后在大火中弹奏钢琴后选择自我了断，对柯南后来的价值观产生了非常重大的影响。
304集（拆分版326-329）：
警校五人组成员的高人气角色松田阵平、萩原研二正式出场，也是高木刑警与佐藤刑警感情的重大突破。
222-224集（拆分版241-243）：
除了平和悬崖场景的经典场面外，人鱼传说最后的悲剧让很多人意难平。
219集（拆分版235-238）：
人气角色怪盗基德登场，除此之外多位名侦探出场，在现场大展身手。
701-704集（拆分版753-756）：
一辆列车全是主线最强大佬，重重危机之下，柯南步步为营，与贝尔摩德的交锋尤为扣人心弦。
345集黑暗的瞳孔：
柯南和小兰遇到了一个神秘的黑暗组织成员。
129集海底的秘密：
柯南和小兰在潜水艇上解决了一起海底谋杀案。
345集迷宫的十字路口：
柯南和小兰在一个废弃的迷宫中追踪犯罪嫌疑人。
这些集数不仅情节紧凑、推理精彩，而且在故事中引入了许多重要的角色和事件，是《名侦探柯南》中不容错过的高质量剧集。建议根据个人喜好选择观看。