图位克隆（Map-based cloning）又称定位克隆（positional cloning），是一种基于目标基因在染色体上的位置来逐步确定和分离目标基因的技术方法。该方法无需预先知道基因的DNA顺序或其表达产物的有关信息，但需要有以下两方面的基本情况：
1. 有一个根据目的基因的有无建立起来的遗传分离群体，如F2、DH、BC、RI等。
2. 开展以下几项工作：
首先找到与目标基因紧密连锁的分子标记。
用遗传作图和物理作图将目标基因定位在染色体的特定位置。
构建含有大插入片段的基因组文库（如BAC或YAC库）。
以与目标基因连锁的分子标记为探针筛选基因组文库。
通过染色体步行、登陆或跳跃获得含有目标基因的大片段克隆。
通过亚克隆获得带有目的基因的小片段克隆。
通过遗传转化和功能互补验证最终确定目标基因的碱基序列。
图位克隆技术的特点是利用分子标记技术对目的基因进行精确定位，然后通过筛选DNA文库和构建物理图谱，逐步逼近并最终克隆目的基因。这种方法在植物基因克隆中尤为常用，当基因的表达产物和基因功能信息未知时，图位克隆法是一种有效的基因分离和克隆策略。