对宝马E90的脚部空间模块（Footwell Module）进行编程的步骤如下：
准备编程设备
需要使用适用于宝马E90的编程设备，如Carly或INPA等。
连接编程设备
将编程设备连接到车辆的OBD II接口上。
进入编程模式
在编程设备上选择相应的模块和功能，进入编程模式。
选择脚部空间模块
在编程设备上选择脚部空间模块（Footwell Module），并进入编程界面。
设码
在编程界面上，根据具体需要进行设码，如更改灯光设置、音频设置、车窗设置等等。
保存设置
在设码完成后，将设置保存到脚部空间模块中。
退出编程模式
退出编程模式，断开编程设备和车辆之间的连接。
注意事项：
设码前最好备份一下原始设置，以便在需要恢复时使用。
不建议自行进行设码操作，建议寻求专业技术人员的帮助。
这些步骤应该能够帮助你完成宝马E90脚部空间模块的编程。如果你不熟悉这些步骤或遇到困难，建议联系专业的汽车维修技术人员以获得帮助。