在更换宝马X5的JBE（连接盒电子装置）后，设码编程的步骤如下：
选择宝马V49.11以上版本
打开宝马诊断系统，确保使用最新版本，以便支持新的JBE模块。
选择编程/编码
在诊断系统中，选择“编程”或“编码”功能，以进行后续的设码操作。
选择车辆系列
选择“5系列”，因为X5属于宝马5系列车型。
选择车辆型号
选择具体的车型，例如“5_F10/F11/F18”，具体车型代码请参考车辆手册或诊断系统中的信息。
选择编码（重新编码）
在编码选项中，选择“编码（重新编码）”，以便对新的JBE模块进行设码。
选择编码系统列表
在弹出的窗口中，选择“编码系统列表”，查看并选择适用于新JBE模块的编码系统。
选择JBE/JBBF
在编码系统列表中，选择“JBE/JBBF”，以对新模块进行设码。
手动选择设码数据
如果系统没有对应设码数据，会提示手动选择一个设码。可以选择任意值，但建议选择当前集成等级的数据（标记为“*”），或者选择等级最低的设码，以确保系统兼容性。
完成以上步骤后，系统会对新的JBE模块进行设码，无需进一步编程操作。如果设码过程中遇到问题，建议参考宝马官方维修手册或联系专业的汽车维修技术人员以获得帮助。