使用R3圆弧刀加工圆弧时，编程主要采用G2（顺时针）和G3（逆时针）的指令格式，具体编程方法如下：
顺时针圆弧加工（G2）
格式：`G2 XZR`
其中，`X` 和 `Z` 是圆弧的终点坐标，`R` 是圆弧的半径。
例如，加工一个半径为3mm的顺时针圆弧，从点（10, 10）开始，到点（20, 10）结束，编程指令为：
```
G2 X20 Z10 R3
```
逆时针圆弧加工（G3）
格式：`G3 XZR`
其中，`X` 和 `Z` 是圆弧的终点坐标，`R` 是圆弧的半径。
例如，加工一个半径为3mm的逆时针圆弧，从点（10, 10）开始，到点（20, 10）结束，编程指令为：
```
G3 X20 Z10 R3
```
注意事项：
刀具半径补偿：如果使用不同半径的刀具，需要进行刀具半径补偿。通常使用G41（外圆弧补偿）和G42（内圆弧补偿）指令，并设置相应的偏置值或使用刀具半径补偿函数。
切削参数：在编程时，需要根据加工精度和表面质量要求，选择合适的进给速率和切削速度。
坐标系和起点：定义程序开始点和结束点，插入刀具和工件，设置刀具和工件坐标系，并移动到刀具路径的起点。
示例程序：
```
； 定义程序开始点
G00 X10 Y10 Z1
； 切换到半径为R3的圆弧刀
T3 M6
； 顺时针圆弧加工
G2 X20 Z10 R3
； 逆时针圆弧加工
G3 X20 Z10 R3
； 定义程序结束点
M30
```
通过以上步骤和示例程序，可以实现使用R3圆弧刀进行圆弧加工的编程。请根据具体的加工需求和机床系统，调整相关参数和指令。