宝元系统M99的编程方法如下：
调用子程序指令
一般使用M98指令调用子程序，而M99指令用于回主程序。
调用子程序的格式为：`M98 OXXXX`，其中`XXXX`是子程序号。
多次调用子程序
如果需要多次调用子程序，可以在程序号后加`PXX`次数，其中`XX`是循环次数。
例如，调用子程序5次可以表示为：`M99 L5 P1000`。
循环次数的编程方法
指定循环次数：在M99指令中，`L__`参数用于指定循环的次数，这是一个整数值，表示需要重复执行子程序的次数。例如，执行子程序5次可以编写为：`M99 L5 P__`。
使用计数器实现灵活控制：通过递增计数器的方式控制循环次数。每次执行子程序时，计数器递增，当计数器达到设定值时，跳出循环。例如：
```
10 = 0 ； 初始化计数器N1
M99 L10 P__ ； 执行子程序，次数由计数器控制
10 = 10 + 1 ； 计数器递增
IF [10 LT 5] GOTO 1 ； 如果计数器小于5，跳转到标号1处，继续循环
```
程序号
程序号是可选项，用于指定循环结束后要跳转到的程序段或指令。
例如，在主程序中调用子程序并希望循环执行5次后跳转到程序号10，可以编写为：`M99 P5 Q10`。
循环和跳转功能
M99不仅可以用于结束子程序并返回到主程序，还可以实现循环和跳转功能，这在自动化加工中非常有用。
实例
循环计数：可以使用M99指令实现循环计数功能。例如：
```
G90G99G01X10Y10Z10G01X20Y20Z10G01X30Y30Z10G01X40Y40Z10G90
```
条件判断：可以根据特定条件决定循环次数。例如：
```
G90G99G01X10Y10Z10IF[X,Y]GT[20,20]GOTO100IF[X,Y]LT[10,10]GOTO200GOTO300100G01X20Y20Z10GOTO400200G01X10Y10Z10GOTO400300G01X30Y30Z10G90
```
循环嵌套：在复杂场景中，可以使用嵌套循环来实现特定功能。例如：
```
O0001（主程序号）
N10G00 X0 Y0（快速定位到起始点）
N20M98 P1000（调用子程序，P1000是子程序号）
N30G00 X100 Y100（移动到下一个位置）
N40IF [1 LE10] GOTO N20（如果计数器1小于或等于10，则跳转到N20继续执行）
N50M30（主程序结束）
O1000（子程序号）
N100G01 X10 Y10 F100（线性插补，移动到X10, Y10）
N110G00 X0 Y0（快速返回起始点）
N120M99（子程序结束，返回主程序）
```
通过以上步骤和实例，你可以掌握宝元系统M99的编程方法，实现子程序的调用、循环控制以及条件判断等功能。