纪检工作存在的问题主要包括以下几个方面：
盲目扩大范围
一些地方和单位，纪检机构过于注重形式主义，将其职能范围扩大到无关紧要的事务上，导致精力分散，影响了正常的工作开展。
缺乏有效监督和制约
一些纪检机构在监督其他部门时存在职责不明、手段单一且缺乏针对性等问题。此外，一些纪检干部可能受到权力腐败问题的影响，失去了自我约束和廉洁自律意识。
依从性较强
纪检干部可能存在过度追求绩效指标和上级评议意见的情况，导致对违规行为不予处理或者轻处罚。甚至在面临利益冲突时选择回避。
决策机制不够科学合理
一些地方和单位内部没有建立起完善的决策机制，在处理涉及党风廉政建设相关事务时容易出现个人独断独行、随意行使权力的情况，缺乏科学性和公正性。
缺乏专业化人才
由于纪检工作的特殊性和复杂性，需要具备丰富经验和扎实专业知识的人才来担任纪检干部。然而，在一些地方和单位，对培养、选拔及任用纪检干部的重视程度不够，导致纪检队伍整体素质有待提升。
执纪追责不力
在一些案件中，存在着处理违纪干部不力或者主动回避问题的现象。这种情况可能是因为相关干部担心自身利益受损或害怕与当事人产生冲突等原因导致。
对基层监督薄弱
虽然纪检工作注重从源头上预防腐败问题，但在一些基层单位，由于基层纪检力量相对薄弱，监督手段不完善，容易出现疏忽或忽视问题的现象。
信息化建设滞后
信息化建设滞后，影响了纪检工作的效率和质量。
思想认识不到位
存在等靠要思想，缺乏大局意识、忧患意识、服务意识，不能把反腐倡廉工作放在我国经济社会发展的大背景下，放在党的建设的大局中去把握。
领导体制问题
对同级党委的监督和对同级党委副职的初核等，在实际工作中很难落实。基层纪检监察干部兼职过多，专职不专现象严重，工作关系不顺，精力难以集中。
工作机制不科学
科学的工作机制尚未系统建立，科学的工作方法尚未探索形成，加之缺乏有效的落实措施，工作方法简单、工作落实不到位。
职能发挥不全面
职能错位，存在大包大揽倾向，有时还充当了开山斧、救火队的角色。职能作用发挥不够全面充分，不能准确把握教育、监督、惩处、保护四项职能。
队伍建设不完善
纪检监察干部队伍建设中存在问题，包括干部思想不稳定、工作作风不够扎实、纪律约束不够严明、业务培训不够全面、管理体制不够完善。
业务素质不全面
许多基层乡镇纪委书记是从其他行业和部门调任或提任过来的，没有具备纪检监察业务知识，更没有案件查办能力和水平，缺乏专业人才。
“三转”不够到位
部分乡镇纪检监察干部“人专职不专”“名专实不专”，工作中仍存在职能泛化、事事参与、职责弱化等不良现象。
同级监督难
对同级党政领导班子成员进行监督的难题长期存在，主要存在思想上的障碍、制度机制上的障碍和实践层面上的障碍。
“四风”根治难
当前，作风建设成效显著，但病源还在、病根难除，停留在“不敢”层面，监督机制、预防制度制订数量多、执行效果低。
这些问题的存在，影响了纪检工作的效果和权威性，需要各级纪检机构高度重视，并采取有效措施加以改进。