合同收尾管理程序主要包括以下几个步骤：
组织编制项目竣工计划
项目经理负责全面负责项目竣工收尾工作，组织编制项目竣工计划，并报分（二级）公司技术质量处审批。
技术质量处检查验收
技术质量处对竣工计划进行检查验收，确保项目按照预定标准和要求完成。
提交项目竣工结算报告及资料
项目部在项目完成后，向建设单位提交项目竣工结算报告及完整的结算资料，并按规定进行竣工结算。
编制回访保修工作计划和保修制度
项目部根据合同和有关规定编制回访保修工作计划和保修制度，并报分（二级）公司技术质量处审批后按计划进行回访。
项目交付物的验收和确认
对项目的交付物进行全面检查和确认，确保其质量符合预期要求，包括对项目成果、文档、产品等进行验收。
项目目标的评估和确认
对项目的目标进行评估和确认，确保项目的目标已经实现。
费用核销
收尾项目的尾工、整修、交验、结算、清算等业务所需发生的费用，需上报费用计划并报公司财务部审核同意后方可发生费用。
人员管理
项目进入收尾阶段，项目部对项目在岗人员进行清理造册，并明确收尾负责人及主要岗位人员，承担收尾、交验过程中相关事宜的处理工作。
签署工程质量保修书
项目竣工验收后，项目部应在约定的期限内向建设单位提交项目竣工结算报告，并签署工程质量保修书，明确质量保修范围、期限、责任和费用的承担情况。
召开回顾会议
项目收尾阶段，召开回顾会议，分享和记录经验教训，以便未来改进。
这些步骤确保了项目在结束前能够按照合同要求完成所有必要的工作，包括质量验收、结算、保修等，从而保障项目的顺利交付和客户的满意度。