村总支换届的程序主要包括以下几个步骤：
准备阶段
成立换届选举工作领导小组，负责选举的组织和协调工作。
制定换届选举方案，包括选举时间、地点、选举方式、候选人资格条件、选举程序等，并报上级党组织审批。
候选人推荐与审核，采取党员民主推荐与上级党组织提名相结合的方式，并对初步人选进行资格审查。
宣传动员阶段
通过公开栏、标语、召开党员大会、村民代表会议等形式进行广泛宣传，确保换届选举工作家喻户晓。
组织学习相关政策和文件，明确换届选举的目的、意义、要求，统一思想。
民主推荐阶段
组织民主推荐，包括党内推荐和群众推荐。党内民主推荐由全体党员参加，群众推荐可以包括不是党员的村委会成员、村民代表等。
根据推荐结果，研究确定新一届村党支部委员候选人初步人选，并在村务公开栏中公示。
选举大会阶段
召开党员大会，清点人数，宣布选举开始。由党支部书记或组织指定的党员主持会议。
介绍候选人名单，向全体党员介绍候选人的基本情况和工作能力。
组织投票，一般采取无记名投票方式，确保选举的公平、公正。到会党员人数必须达到或超过有表决权党员的2/3，否则选举无效。
成立计票小组和监票小组，由非候选人党员组成，负责统计选票和监督选举过程。
计票与宣布结果阶段
计票结束后，当场宣布选举结果。候选人获得超过到会党员半数赞成票方可当选。
如果支部书记选不出或支委委员选不足，则对空缺职位进行重新选举，并当场宣布重新选举结果。
上报和批复阶段
支部（总支）将选举结果上报乡镇党委。
乡镇党委对选举结果进行审核后批复。
乡镇党委及时向县委组织部报送本乡镇村党组织换届选举结果、有关报表和总结材料，并做好文件、材料的归档工作。
以上是村总支换届的基本程序，具体操作中可根据实际情况进行适当调整。建议在换届选举过程中，严格按照程序进行，确保选举的合法性和公正性。