派出所处理案件的程序主要包括以下几个步骤：
接受报案
派出所接到报案后，应当迅速受理并进行登记。
对于不属于公安机关职责范围内的事项，告知当事人向其他有关主管机关报案或者投案，并说明理由。
立案
对于属于公安机关职责范围内的案件，应当立即接受并进行审查。
经过审查，认为有犯罪事实需要追究刑事责任的，应当立案。
对于不属于自己管辖的，应当移送主管机关处理，并且通知报案人。
调查取证
立案后，派出所应当立即进行调查取证，包括询问报案人、控告人、举报人、投案人，并对相关场所、物品、人身进行检查。
询问笔录应当交被询问人核对，并在确认无误后签名或盖章。
告知
在调查过程中，派出所应当及时告知报案人、控告人、举报人、投案人案件的进展情况。
对于决定不予立案的，公安机关应当制作《不予立案通知书》，并在七日内送达控告人，同时告知其可以申请复议。
作出处罚决定或出具调解协议
根据调查结果，派出所可以作出治安管理处罚决定，如警告、罚款等。
对于因民间纠纷引起的打架斗殴，情节较轻的，可以调解处理，并出具调解协议。
执行
对于决定给予行政拘留处罚的人，由作出决定的公安机关送达拘留所执行。
案件期限
办理治安案件的期限自受理之日起不得超过三十日，案情重大、复杂的，可延长三十日。
查明案情进行鉴定的期间，不计入办理期限。
以上是派出所处理案件的基本程序，具体操作中可能会根据案件性质和具体情况有所调整。公众在遇到案件时，可以咨询派出所工作人员了解案件进展和处理情况。