税务核查程序是指 税务机关依法对纳税人、扣缴义务人履行纳税义务、扣缴义务情况所进行的税务检查和处理工作的总称。税务核查程序通常分为三个阶段，即“检查的准备阶段”、“检查的实施阶段”和“检查的终结阶段”。
检查的准备阶段
下达检查通告：各级税务部门的检查计划确定后，一般由县级以上的（含县级）税务部门的负责人用指令方式委派检查人员，并于进户检查前签发《税务检查通知书》。
检查的实施阶段
审核分析：税务稽查部门对纳税人、扣缴义务人的相关资料进行审核和分析，了解纳税人的基本情况及存在的问题。
约谈举证：在审核分析的基础上，针对发现的疑点问题，要求纳税人到税务机关述明情况，并要求其他部门或异地税务机关进行核查取证。
检查的终结阶段
评定处理：以相关评税资料为基础，根据审核分析或举证确认核实的情况，对审核分析和举证确认的疑点问题进行进一步的评定和处理。
后续管理：对经过核查确认存在问题的纳税人，税务机关会依法采取相应的税务处理措施，并进行后续管理，确保税收合规。
税务核查的目的是确保税收合规，检查纳税人是否按照税法规定正确计算应纳税额，包括企业所得税、增值税、个人所得税等各种税种。通过核查，税务机关可以发现并纠正纳税人的违法行为，保障国家财政收入，维护税收秩序。