将Java程序打成JAR包的原因主要有以下几点：
打包和分发：
JAR包是一个压缩文件，其中包含了必要的Java类文件和资源（如图片、配置文件等）。这种封装使得程序的分发更加简单。
依赖管理：
在大型项目中，往往会有多个依赖库和JAR文件。通过使用JAR包，开发者可以有效管理这些依赖，避免版本冲突。
提高加载速度：
JAR文件是一个压缩包，Java虚拟机在加载时能够更快地读取和解压，而不必逐个加载文件。
安全性：
JAR包可以使用数字签名，增加了代码的安全性，确保代码未被篡改。
方便使用：
打成JAR包后，用户不需要再寻找包含main方法的类去执行，也不需要复制一堆类文件。如果使用第三方JAR包，可以直接在项目中导入JAR包，而不是复制一堆类文件。
可移植性：
JAR文件可以在各种平台上直接使用，只要将JAR文件添加到系统的classpath环境变量之后，Java通常会把这个JAR文件当做一个路径来处理。
服务器优化：
对于Web应用，打成WAR包可以防止文件丢失，并且服务器会对应用做优化，如删除空文件夹等。
综上所述，将Java程序打成JAR包可以显著提升程序的管理和发布效率，同时也有助于提高安全性和加载速度。