农村改水改厕的程序如下：
本人申请
厕所改建前，以户为单位，由户主本人向户籍所在地的村民委员会提出书面申请。
村委初审
村委会入户调查，组织集中评议，并将评议结果在村级政务信息公开栏进行张榜公示，公示无异议后，村委会将所有申请材料上报乡镇人民政府。
乡镇复核
乡镇人民政府组织工作人员上门复核，提出核查意见并公示，公示无异议后，乡镇人民政府将审核结果上报县级主管部门。
县级审定
县级主管部门组织工作人员适当进行抽查核实，提出审定意见并对审定结果进行公示。
工程实施
公示期满后无异议的，由县级人民政府确认后组织实施，同时将实施方案、任务计划及年度改造对象名册上报市级业务主管部门备案。
组织验收
乡镇人民政府组织工作人员验收合格后，按时拨付户厕改造的奖补资金。
建议村民在申请改水改厕时，先了解当地的具体政策和补贴标准，然后按照程序逐步操作，确保改造过程顺畅。