整理磁盘碎片可以使用以下几种程序：
Windows自带的磁盘碎片整理程序
功能：适用于使用FAT、FAT32或NTFS文件系统的卷进行碎片整理，维护磁盘性能。
限制：只能对本地卷进行碎片整理，一次只能对一个卷进行碎片整理，在扫描另一个卷时无法对一个卷进行碎片整理。
IObit Smart Defrag
特点：专业、强大、智能化的高速磁盘整理软件，能够自动优化磁盘碎片，无需设置和人为操作。采用ExpressDefrag技术，整理速度快，支持后台自动整理碎片，节省磁盘空间，提高速度和稳定性。
WinContig
优势：针对NTFS文件系统，迅速为磁盘进行“大扫除”，支持选择性整理单个文件或特定文件夹，提高整理效率。基于微软的标准整理API库，确保整理过程的安全性和系统稳定性。支持独立运行和便携化特性。
Wise Disk Cleaner
功能：免费磁盘清理和磁盘碎片整理工具，包括通用清理器、高级清理器、系统瘦身功能、磁盘碎片整理工具等。提供智能优化功能，按需选择整理方式。
O&O Defrag
推荐理由：第三方磁盘整理工具，能够有效处理难以清理的碎片，避免格式化磁盘的麻烦。支持选择"整理/合并未使用空间"功能，整理过程较为安全。
建议
对于Windows用户：如果系统自带的磁盘碎片整理程序满足需求，可以直接使用。如果需要更高效的整理和优化，可以考虑使用IObit Smart Defrag或WinContig。
对于需要更多功能和更高灵活性的用户：IObit Smart Defrag和WinContig都是不错的选择，前者智能自动整理，后者支持精细化整理。
对于追求极致性能和安全的用户：O&O Defrag是一个值得信赖的选择，尽管它可能比IObit Smart Defrag和WinContig稍贵一些。
根据以上信息，建议选择适合自己需求的磁盘碎片整理工具，以提高磁盘性能和稳定性。