不推荐刷程序的原因主要有以下几点：
影响发动机寿命：
原厂设定的发动机程序经过精心调校，旨在确保燃油经济性、动力输出以及可靠性和耐用性之间的平衡。刷程序往往会打破这种平衡，以追求更高的动力输出为目标，特别是对于涡轮增压发动机，通过调整涡轮压力和燃油喷射量，可以显著提升动力，但这样做通常会增加发动机的负荷，从而可能缩短其使用寿命。
增加油耗：
刷程序后，虽然车子动力提升，但油耗也会相应上升。因为进入发动机的空气和燃油增多，可燃混合气爆炸产生的能量也增大，从而增加了发动机的磨损。
对汽油品质要求更高：
刷程序后，汽车对燃油质量要求变高，需要使用更高品质的汽油，如从92号汽油升级到95号汽油，因为发动机超频运转需要更高品质的汽油作为燃料。
温度要求更高：
发动机超频工作需要更好的冷却系统，否则会对发动机寿命产生影响。
安全风险：
刷机过程中使用的第三方ROM可能存在恶意软件、病毒或其他安全隐患，可能窃取用户的个人信息，甚至可能导致手机系统崩溃或硬件损坏。
保修失效：
如果用户进行了刷机，这一保修权益可能就会失效。因为手机厂商通常认为，刷机后的手机可能存在人为损坏或改动，所以不再属于保修范围。
失去官方支持：
用户选择了刷机后，将失去手机厂商提供的官方系统更新和维护，这意味着即使新的系统版本推出了，用户也必须依靠第三方的力量来进行升级和维护，而第三方的ROM可能无法像官方ROM那样经过严格的测试和审查，存在一定的风险和不确定性。
综上所述，虽然刷程序能带来动力的提升，但也可能以牺牲发动机的寿命、增加油耗、提高对汽油和冷却系统的要求、带来安全风险、导致保修失效以及失去官方支持为代价。因此，在进行此类改装时，车主需要权衡利弊并做出明智的选择。