U盘传输程序时，可以选择以下几种格式：
源代码文件
如果只需要将程序的源代码文件传输到U盘上，可以直接将源代码文件以普通文本文件的形式复制到U盘中。通常，源代码文件的扩展名为.c、.cpp、.java等，取决于所使用的编程语言。
可执行文件
如果已经将程序编译成可执行文件，可以直接将可执行文件复制到U盘中。对于Windows操作系统，可执行文件通常具有.exe扩展名，而对于Linux和Mac OS X等操作系统，可执行文件通常没有扩展名。
压缩文件
将程序文件压缩成一个压缩文件，然后将该压缩文件复制到U盘中。常见的压缩文件格式有ZIP、RAR和7Z等。这样可以节省空间并保护程序文件免受损坏。
安装器
如果您的程序需要安装才能运行，可以将安装器文件复制到U盘中。安装器通常是一个以.exe扩展名结束的文件，可以在双击打开后，按照提示进行程序的安装和配置。
虚拟磁盘文件
有些编程环境和开发工具会创建一个虚拟磁盘文件，该文件包含了程序源代码、配置文件、库文件等。您可以选择将整个虚拟磁盘文件复制到U盘中，然后在目标计算机上打开该文件，并从中访问和运行程序。
文件系统格式选择建议
FAT32格式：
具有极佳的兼容性，适用于所有操作系统和设备，包括支持OTG功能的手机。但是，FAT32格式只能支持小于4GB的单个文件。
NTFS格式：
支持大于4GB的大文件存储，并且是Windows系统默认的文件格式。然而，NTFS分区是采用“日志式”的文件系统，对闪存设备有一定损伤，并且不常被电脑以外设备所识别。
EXFAT格式：
是FAT32的升级版，特别适合于闪存的文件系统，并且支持大于4GB的单个文件。在Windows、Mac和Linux系统中进行读写，适用于跨平台使用的场景。但是，在XP系统上使用时需要补丁文件，否则将不能使用。
综合建议
通常情况建议使用FAT32格式，因为此格式具有最大的兼容性。
如果只是在XP以上系统的电脑上操作，可以使用EXFAT格式。
NTFS格式不建议U盘使用，尽管它支持大文件和高级功能，但在其他系统上的兼容性较差。
根据以上信息，您可以根据具体需求和操作系统选择合适的文件格式来传输程序到U盘。