占用农田的法律程序主要包括以下几个方面：
非法占用农田的认定与处罚
非法占用农田的行为：包括未经批准占用土地、违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地等。
处罚措施：由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划的限期拆除新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，符合土地利用总体规划的没收占地建筑物并可并处罚款。
法律途径
行政复议：在适当时机向法院提出行政不作为的行政复议。
行政诉讼：通过司法诉讼的方式得到救济。
报警与刑事追责：在遭受侵害时立即报警求助，追究侵权人的刑事责任。
行政程序
立案调查：对于非法占用农田的行为，执法部门会进行立案调查，确认违法行为。
处罚决定：自然资源主管部门在调查结束后，会作出行政处罚决定，包括罚款、拆除违建等。
听证与告知：在作出处罚决定前，应告知当事人处罚事实、理由、依据和有关权利，听取当事人的陈述和申辩，必要时举行听证会。
征地程序
国家征地：国家征收土地需依照法定程序进行，包括告知征地情况、确认征地调查结果、组织征地听证、征收土地公告、征地补偿安置方案公告等步骤。
协商与诉讼：在征地过程中，当事人可以通过协商解决问题，协商不成时，可以向人民法院提起诉讼。
综上所述，占用农田的法律程序涉及非法占用的认定与处罚、法律途径的寻求、行政程序的遵循以及征地程序的规范。相关当事人应当严格遵守法律规定，避免违法行为带来的不利后果。