埃及清关程序包括以下几个主要步骤：
进口申请报关
货主必须亲自到海关履行货物申请报手续，或委托代理人交换票据（海关管理局的进口许可证必须按时递交）。
船舶和货物（包括茶叶和烟草）允许免费保存8天，超过8天应交纳滞期费，滞期费用自然增长。在3个月后无人认领的货物由海关公开拍卖。
换取换证凭条（单）
到商检局办理通关单工作（法定商检的可以提前拿到通关单），然后与商检局商检人员预约具体时间到仓库进行监装。
商检局人员到仓库进行监装
商检局人员会先将空箱拍照，然后对每一票货物进行箱数的核对，核对一票装箱一票，并且拍照一票，直到全部装完，再到商检局换通关单，然后才可以安排报关。
报关
通关后5个工作日左右，到商检局领取目的港清关装运前检验证书，国外客户凭此证书才可以在目的港办理清关工作。
出口文件的大使馆认证
出口到埃及的所有货物，其相应单据（产地证和发票）必须到埃及驻华使馆进行使馆认证，盖章后的单据和装运前检验证书才能在埃及目的港进行清关提货。
大使馆认证加签流程包括文件准备、翻译与公证、提交申请、审核与认证、取回文件等步骤。
其他特定文件
根据埃及海关的具体要求，可能还需要提供其他特定的文件，如植物检疫证书、卫生许可证等。
建议出口商提前与埃及进口商或当地清关代理沟通，确保所有文件的完整性和准确性，并提前规划好时间，以便在货物装运前完成所有认证和报关手续。