企业辞退员工的合法程序通常包括以下几个步骤：
明确解除理由
企业需根据《劳动合同法》确定解除劳动合同的理由，如员工严重违反规章制度、不能胜任工作、严重失职等，并收集相关证据支持决定。
通知工会
若企业设有工会，应在作出开除决定前通知工会，工会有权提出意见或建议，企业应认真考虑。
书面通知员工
在确定解除理由并征得工会同意（如有）后，企业应向员工发出单方解除劳动合同的书面通知书，内容必须准确、完整、合法。
与员工沟通
通知员工后，企业应安排与员工进行沟通，听取员工的意见和诉求，就解除劳动合同的具体事项进行协商，如经济补偿、工作交接等。
办理离职手续
双方达成一致后，企业应协助员工办理离职手续，包括结算工资、缴纳社保、转移档案等，并向员工出具解除劳动合同的证明，办理相关登记手续。
结算工资福利和其他未了事宜
有关部门应与员工办理结算工资福利和其他未了事宜，员工在结算工资和发放经济补偿的财务手续上签字领取。
办理团、工会组织关系和档案转移手续
企业应为员工办理团、工会组织关系和档案等转移手续。
办理社会保险和公积金转移手续
企业还需为员工办理社会保险转移单和公积金转移手续等事项。
开具解除劳动合同证明
最后，企业给员工开具《解除劳动合同证明》。
预见并应对可能的问题
在整个过程中，企业应预见并应对可能遇到的问题，如员工提出不合理要求或情绪反应，提前准备好法务团队和人力资源团队的帮助。
这些步骤旨在确保企业辞退员工的过程合法合规，同时尽可能减少对员工的影响，维护良好的劳动关系。