苹果系统（iOS）主要不兼容以下类型的程序：
非官方或专为其他平台如安卓开发的应用 ：这些应用可能无法完美运行，可能会有界面问题或者功能受限。深度依赖Windows API的软件：
由于iOS是基于Unix的，而Windows API是微软开发的，因此深度依赖Windows API的软件在iOS上通常无法运行。
某些编程软件和开发工具
Visual Studio：
这是一款针对Windows操作系统设计的强大集成开发环境（IDE），不能直接在苹果系统上运行。不过，苹果系统上有替代品如Visual Studio Code。
.NET Framework：这是微软的一种开发框架，用于创建Windows应用程序和Web应用程序，苹果系统上的开发者可能需要使用其他框架，例如Java或Swift。
一些知名安全工具和杀毒软件：
例如，苹果新系统macOS 15 Sequoia并不兼容多个知名安全工具和杀毒软件，如CrowdStrike、SentinelOne、微软等公司的产品。
特定格式的软件文件：
例如，苹果笔记本电脑在Mac OS X系统里至少不兼容.exe和.rar两种格式的软件。
建议
选择兼容的应用：在安装或更新苹果系统时，应尽量选择那些已经适配iOS平台的应用程序，以确保良好的用户体验和兼容性。
使用替代工具：对于某些必须使用的软件，可以考虑寻找其在苹果系统上的替代品，如使用Visual Studio Code替代Visual Studio，或者使用其他支持跨平台的开发框架。
检查软件兼容性：在安装任何新软件之前，最好先确认其是否与当前系统兼容，以避免不必要的问题。