员工离职退工的程序主要包括以下几个步骤：
提前通知或协商解除
员工可以选择与用人单位协商一致解除劳动合同，或者提前三十日以书面形式通知用人单位解除劳动合同。
用人单位审批
用人单位需要审批员工的离职申请。
办理离职手续
办理工作交接手续，包括填写《离职员工交接手续表》、《工作交接明细表》和《物品交接单》，并由交接双方和部门领导签字确认。
办理离职工资结算手续，确保工资和其他福利得到妥善处理。
办理离职证明，以便员工未来求职时使用。
办理离职社保转移手续，包括保险减员和公积金转移等。
提供培训或调岗机会
如果员工被确认为不胜任工作，企业应提供改进的机会，包括额外的培训资源或调整到新的岗位。
确认不胜任状态
在员工接受培训或调岗后，如果仍然无法达到岗位要求，企业需要确认员工的持续不胜任状态，并有充分的证据支持。
解除劳动合同
在满足上述条件后，企业可以依法解除劳动合同，并可能需要支付经济补偿。
记录和备案
办理劳动合同终止手续，并出具《解除劳动合同证明》。
到失业保险经办机构办理终止、解除劳动关系备案手续，并中止职工社会保险关系。
档案和工资处理
将离职员工的档案重新归档，并结清工资。
以上步骤均依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定进行，确保员工离职过程的合法性和规范性。建议企业在员工离职时，严格按照上述流程操作，以维护双方的权益。