机井启用程序通常包括以下几个步骤：
受益农户议定管理方式并制订管理制度
受益农户通过“一事一议”的方式议定机井的管理方式，并制订相应的管理制度。
向所在村申请
受益农户向所在的村庄提交机井启用申请。
乡镇水利站审核
乡镇水利站对申请进行审核，确保申请符合相关规定和要求。
乡镇政府签署意见
乡镇政府对审核结果签署意见，表示同意或不同意机井启用。
县水利局批准
县水利局对申请进行最终审批，并决定是否批准机井启用。
水利部门负责运行管理
由水利部门负责运行管理的地下水机井，需要依法办理收费许可证，并按照价格主管部门核定的标准收取水费，确保机井正常运行。
此外，对于机械设备的启动操作，还需要遵循以下安全措施：
在检查设备时，如果发现任何异常情况，必须停机处置，不准人员在设备2米范围内检查，以防止机械伤害和物体打击事故。
建议在申请机井启用时，详细咨询当地农村水利部门或农村水务管理机构，了解具体的申请要求和程序，以确保申请过程顺利进行。