清溪水库的审批程序包括以下几个主要阶段：
前期准备阶段
项目建议书或可行性研究报告编制：项目建议书或可行性研究报告是审批的基础，需详细阐述项目建设的必要性、技术可行性、经济合理性等。
规划选址和用地预审：项目需通过自然资源部门的规划选址和用地预审，确保项目用地的合法性和合规性。
审批阶段
建设项目用地预审意见书核发：通过用地预审后，将获得用地预审意见书。
选址意见书核发：项目需获得选址意见书，明确项目建设地点的合法性。
建设用地规划许可证核发：在获得选址意见书后，项目需获得建设用地规划许可证。
建设项目压覆重要矿产资源审批：若项目涉及压覆重要矿产资源，需进行审批。
海域使用预审：若项目涉及海域使用，需进行海域使用预审。
移民安置规划审核：项目需制定移民安置规划，并通过相关部门的审核。
地震安全性评价：项目需进行地震安全性评价，确保工程安全。
建设工程文物保护和考古许可：若项目涉及文物保护和考古，需获得相关许可。
建设工程避免危害气象探测环境的意见：项目需避免对气象探测环境造成危害。
可行性研究报告审批或项目申请报告核准：最终，项目需通过可行性研究报告的审批或项目申请报告的核准。
施工阶段
施工图纸审查：项目需提交详细的施工图纸，包括水库的平面布置、截面形态等。
安全生产许可证明：项目需获得安全生产许可证明，确保施工和运营过程中的安全。
后期阶段
初审阶段：提交申请材料，水利行政主管部门进行初步评估和合规性审核，并通知申请方初审结果。
技术审查阶段：组织专家对申请材料进行技术审查，评估项目的可行性和风险，并编制技术审查意见表。
环保评估阶段：进行环境影响评价，编制评价报告，并通过环保部门的审查。
规划审查阶段：申请土地规划许可，并通过土地管理部门的审查。
验收和运营阶段
项目竣工验收：项目竣工后，需进行竣工验收，确保项目符合设计要求和相关标准。
运营和维护：项目投入运营后，需进行定期维护和管理，确保水库的正常运行和安全性。
建议项目申请方严格按照上述程序进行申请和审批，确保项目顺利进行并符合相关法律法规要求。