股权变更税务办理流程如下：
前期手续
通过股东大会决定并进行修改公司章程，履行合法手续。
准备变更材料
准备股东大会决议、修改后的公司章程、法定代表人签名及身份证件印章。
变更股东的身份证和持股情况，以及公司的申请。
工商变更登记
将上述材料带到工商登记机关，办理营业执照变更，拿到新的营业执照。
税务部门提交申请
携带相关材料，包括工商营业执照变更和股权变更的材料，向税务部门提交变更申请。
缴税
根据股权转让情况，缴纳个人所得税、印花税和企业营业所得税。
完成税务变更
缴纳税款后，税务部门会很快登记税务变更。
详细步骤
确定税款所属日期
明确税款所属日期，通常截至上个月的月底。
审查财务报表
审查税款所属期内的财务报表，重点关注未分配利润、所有者权益、固定资产等关键事项。
申报印花税与个人所得税
在财务报表确定后，申报新老股东的印花税（税率为0.05%）和个人所得税（税率为20%）。
确定股权转让定价
确保股权转让的定价合理，避免因定价问题引发退税流程。
准备股权转让协议
准备股权转让协议，一式四份，以备后续提交审批流程。
出具完税证明
提交所有材料无误后，预计2-15个工作日内将出具完税证明，然后开始变更工商股东信息。
税务登记信息变更
携带新的营业执照、原税务登记证、法人身份证等材料到税务局办理税务登记证变更。
更新税务系统中的企业名称信息
确保发票开具、纳税申报等环节的顺畅进行。
个人所得税申报
股权转让方需要缴纳个人所得税，到主管税务机关办理纳税申报，并持完税凭证到工商行政管理部门办理股权变更登记手续。
印花税申报
股权转让协议签订后15日内，转让方和受让方都需要申报印花税。
银行信息变更
携带新的营业执照、税务登记证等材料，到基本户开户银行办理银行信息的变更。
建议
确保所有材料的真实性和完整性，避免因材料问题影响变更流程。
提前规划好时间，确保在工商和税务部门的变更登记和缴税工作能够按时完成。
在整个过程中，与工商和税务部门保持良好沟通，及时解决可能出现的问题。