国务院组成部门和直属机构的区别主要体现在以下几个方面：
地位和组成
国务院组成部门：参加国务院全体会议的部门，相当于这些部门合起来就是国务院，它们组成了一个整体。组成部门包括各部、各委员会、中国人民银行和审计署等，其成立、撤销要由全国人大决定，部长们也是人大任免（副职由国务院任免）。
国务院直属机构：某些业务非常专业且重要，单独成为组成部门会范围太单一，因此直接归属于国务院组成部门的管理。例如海关总署、税务总局、市场监管总局、金融管理总局等。直属机构主管国务院的某项专门业务，具有独立的行政管理职能。
职能
国务院组成部门：依法分别履行国务院基本的行政管理职能，涵盖政策拟定、市场监管、公共服务等多方面事务。
国务院直属机构：主管国务院的某项专门业务，具有独立的行政管理职能，管的相对少的多，都是特定领域。
人事任免
国务院组成部门：行政首长（部长、主任、行长、审计长）是法定的国务院组成人员，其任免须由国务院总理提请全国人大及其常委会决定。
国务院直属机构：设立、撤销、合并可由国务院自己决定，其行政首长由国务院自己来任免。
政治地位
国务院组成部门：组成部门及其行政首长的政治地位通常要略高于直属机构，负责人都是国务院的组成人员，有权参加国务院全体会议。
国务院直属机构：负责人不是国务院组成人员，一般只能列席国务院相关会议。
机构性质
国务院组成部门：为行政机关，机关人员全部使用公务员行政编制。
国务院直属机构：为行政机构，机关人员也是公务员，执行公务员待遇。
管理方式
国务院组成部门：构成国务院，对人大负责，向人大汇报工作，接受人大监督。
国务院直属机构：隶属于国务院，由国务院管理，对国务院负责。
总结：
国务院组成部门和直属机构在地位、职能、人事任免、政治地位、机构性质和管理方式等方面存在明显的区别。组成部门是国务院的核心组成部分，具有更高的政治地位和更广泛的行政管理职能，而直属机构则专注于特定业务，具有相对独立的行政管理职能，但在政治地位和参与国务院会议方面受到限制。