《金陵十三钗》的小说结局如下：
玉墨幸存 ：玉墨是唯一一个从日军手中幸存下来的女子。她因为相貌和格调出众，被日军中下级军官所宠爱，从而放松了对她的看管，使她有机会逃跑成功。其他女子悲惨命运
在日军享用后，其他11个女子被发送到慰安所。
她们中有的人在试图逃亡时被击毙，有的人染病而死，个别选择自杀。
审判与指证：
1946年8月，玉墨在南京审判会上指证了日军的暴行。书娟从她的背影和声音认出了她，但玉墨却装作不再认识书娟，结局颇为悲剧。
孟先生和小男孩：
孟先生被日本军官打死，而小男孩则被日本人带上车。神父利用孟先生给的通行证，将女学生们藏在大卡车里，成功通过了关卡。
这些细节构成了《金陵十三钗》小说沉重的结局，突显了战争的残酷和对人性的摧残。