《孤岛惊魂5》的结局主要有以下几种：
隐藏结局
主角选择不抓神父，等一会儿会自动触发离开动画。
悲剧结局
主角选择离开，但被精神控制了的盟友不会杀朋友，主角和朋友离开，但盟友全部留下，因为主角被雅各洗脑，听见歌曲《Only you》就会性情大变，在离开中车上警长点开了收音机，触发悲剧结局。
反抗结局
主角选择反抗，打倒所有被精神控制的盟友和朋友，最后清醒并逮捕神父，在倒计时之前赶往堡垒，触发核弹爆发剧情。
好结局
玩家解决三个地区副首领，在圣夫面前选择“抵抗”，战斗后核弹爆炸，玩家与队友们匆忙押着圣夫上车驶向地堡，但即将到达地堡时发生车祸，玩家陷入昏迷。醒来后，发现自己双手被捆绑，身边只剩下了圣夫和生死不明的道奇。圣夫发誓要创建一个新的家庭，而主角会成为他的第一个孩子。
坏结局
玩家解决三个地区副首领，在圣夫面前选择“离开”，核弹没有爆炸，玩家一行人安全地驾车离开。但警长手贱地打开了广播，“Only You”的音乐声响起，玩家视角开始变得血红，最终杀掉车上的所有人。
建议：
玩家可以根据自己的游戏风格和理解，选择不同的结局。如果想要体验不同的剧情走向，可以尝试完成隐藏结局或反抗结局。如果想要一个震撼的结局，可以选择好结局或坏结局。