关于《海贼王》中路飞和女帝的结局，目前存在多种猜测和解读：
朋友关系：
有观点认为路飞和女帝最终只是朋友关系，女帝对路飞有好感，但路飞并未对她有感觉。
单相思：
也有推测认为女帝会单相思路飞，而路飞最终会离开蛇岛，留下女帝独自等待。
婚礼与幸福生活：
有猜测称在故事结尾，路飞成为海贼王后，与女帝举行婚礼并过上幸福生活。
分离与再会：
另一种观点是，路飞和女帝可能会因为各自的使命和理想而分离，但最终路飞会回来找女帝，两人再次相聚。
未明确结局：
由于《海贼王》漫画尚未完结，目前还无法确定路飞和女帝的最终结局。
爱情与新生：
有推测认为，在大结局中，路飞和女帝不仅在一起，还育有孩子，象征着爱情赋予世界的礼物和新时代的诞生。
综合以上信息，可以得出以下结论：
目前没有确凿的证据表明路飞和女帝最终会在一起，他们的关系仍然是一个未解之谜。
由于漫画尚未完结，任何关于他们结局的说法都只能是基于猜测和推测。
因此，建议粉丝和读者耐心等待尾田荣一郎在漫画中揭晓最终答案。