三峡工程虽然带来了巨大的经济和社会效益，但同时也存在一些严重后果，主要包括以下几个方面：
生态环境恶化
水质污染：三峡两岸城镇和游客的排放的污水和生活垃圾，未经处理直接排入长江，导致水质恶化和垃圾漂浮，可能引发传染病。
生态破坏：三峡工程蓄水后，水流静态化，污染物不能及时下泻而蓄积在水库中，对下游的水供应和生态环境造成破坏。
生物多样性减少：三峡完全蓄水后将淹没560多种陆生珍稀植物，部分物种面临灭绝的危险。
地质灾害
山体滑坡和岩崩：三峡工程蓄水后，导致震源很浅的岩溶塌陷和库岸调整，可能引发山体滑坡和岩崩。
地质灾害频发：大坝阻挡了淤泥流向下游，导致上游地区的地质灾害频发，如泥石流、地面塌陷等。
航运和灌溉问题
航运困难：三峡工程使长江水域通航困难，影响长江航运的经济效益。
灌溉影响：水库的蓄水能力影响长江中下游地区的灌溉，可能导致农田缺水，影响农业生产。
经济和社会影响
移民问题：三峡工程导致大量移民搬迁，给当地居民的生活和社会秩序带来沉重负担。
经济损失：泥沙淤积问题严重，影响水库的蓄水空间，可能导致发电效率下降，给经济带来损失。
潜在灾难：如果三峡大坝遭到攻击或被毁，将引发巨大的洪水灾害，可能造成数千万人的死亡和数亿人的受灾。
其他潜在风险
气候变化：有人认为三峡工程可能会使得全球的气候和海洋环境发生重大变化。
水循环破坏：大坝蓄水破坏了水循环，导致云南等地出现连续大旱，多处河流断流。
综上所述，三峡工程在带来巨大经济和社会效益的同时，也带来了一系列严重的环境和社会问题。这些问题需要得到高度重视和持续治理，以确保三峡工程的可持续发展和社会的和谐稳定。