微信理财通和余额宝都是提供理财服务的平台，它们之间存在一些区别，主要体现在以下几个方面：
所属公司不同
微信理财通：由腾讯公司开发，发布在微信平台上，提供商是华夏基金。
余额宝：由阿里巴巴集团开发，绑定支付宝，提供商是天弘基金。
转入额度不同
微信理财通：试运行期间单卡单日不超过8000元，每个理财通账户资金不超过100万元。
余额宝：每日无限额，储蓄卡快捷支付单笔不超过5万，每日不超过5万（电脑端是不超过5000），每月不超过10万，每个账户资金不超过100万元。
购买平台不同
微信理财通：主要通过微信平台进行购买。
余额宝：可以在支付宝平台以及电脑端进行购买。
到账时间不同
微信理财通：支持工行、农行等11家银行2小时到账，其他银行1-3天内到账。
余额宝：手机端支持2小时到账，电脑端24小时到账。
转入转出不同
微信理财通：只能和银行卡进行转入转出。
余额宝：资金可与支付宝自由转出转入，同时也可以转入到银行卡，还可以购物。
回报率不同
微信理财通：截止2018年2月11日，其七日年化回报为5.08%。
余额宝：2018年2月10日，余额宝七日年化回报为4.0630%。
灵活性和便利性
余额宝：灵活性较好，可以随时存入和随时取出，十分方便，并且可以直接用于购物和转账。
微信理财通：虽然也可以随时取出，但大部分理财产品需要T+1日才可以赎回到账，在灵活性方面略逊于余额宝。
安全性
余额宝：资金流动性好，取出的时间没有限制，但安全性方面可能稍逊于微信理财通，因为余额宝在电脑和手机上操作时不需要输入密码。
微信理财通：资金提现只能通过安全卡并输入短信验证码，相对较为安全。
建议
如果经常使用微信支付，并且希望有较高的收益和较好的灵活性，可以考虑使用微信理财通。
如果习惯使用支付宝进行日常支付和购物，并且希望资金能够灵活周转，同时注重资金的安全性，余额宝是一个不错的选择。
两者各有优势，投资者可以根据自己的使用习惯和需求来选择合适的理财平台。