发工资时扣除社保的会计分录通常包括以下几个步骤：
1. 计提工资和社保费用：
```
借：管理费用/生产成本/制造费用/销售费用等
贷：应付职工薪酬——工资
应付职工薪酬——社会保险费（单位部分）
```
2. 实际发放工资，并代扣个人社保费用：
```
借：应付职工薪酬——工资
贷：银行存款/库存现金
其他应付款——社会保险费（个人部分）
```
3. 实际缴纳社保费用：
```
借：应付职工薪酬——社会保险费（单位部分）
其他应付款——社会保险费（个人部分）
贷：银行存款
```
以上步骤反映了企业发放工资并从工资中扣除社保费用，然后向社保机构缴纳相应费用的过程。请根据实际业务发生的时间和具体情况调整分录