大产权房和小产权房的区别主要体现在以下几个方面：
产权归属
大产权房：是指购房者拥有完整的房屋所有权和相应的土地使用权。这些房屋的建设经过了一系列严格的审批程序，包括土地出让、规划许可、施工许可以及竣工验收等环节，符合国家法律法规和相关政策的要求，能够依法办理房屋所有权证和土地使用证（现在多为不动产权证）。
小产权房：则是在农村集体土地上建设的房屋，未缴纳土地出让金等费用，其土地使用权的流转受到严格限制。小产权房往往是由乡镇政府、村集体或村民自行组织建设，缺乏完整的开发建设手续，无法像大产权房那样取得合法的产权证书，仅能颁发一些由乡镇政府或村集体自制的证明文件，在法律层面上其产权界定较为模糊。
合法性
大产权房：是合法的，是有国家颁发的产权证的。这些房屋符合国家法律法规和相关政策的要求，能够依法办理房屋所有权证和土地使用证，其产权受法律全面保护。
小产权房：国家是不发产权证的房子。乡镇政府发放的产权证书实际上不是真正的产权，这种房屋没有国家发放的土地使用证和预售许可证，有关部门不会予以备案。
交易税费
大产权房：在房屋再次转让时，如果不用交付土地出让金，那么为大产权。如果仍然需要补缴土地出让金，这样的产权叫小产权。
小产权房：由于未缴纳土地出让金等费用，其交易税费与合法的大产权房存在差异，且在法律层面上其产权界定较为模糊，购买后转让存在诸多限制。
权益保障
大产权房：购房者享有广泛而坚实的权益保障，可以自由处分房产，包括出售、抵押、继承等，并且在面临房屋质量问题、开发商违约等情况时，能够依据相关法律法规和购房合同，通过合法途径维护自己的权益。
小产权房：由于产权不完整，购房者享有的权益有限，且在面临房屋质量问题和开发商违约等情况时，难以通过合法途径维护自己的权益。
综上所述，大产权房和小产权房在产权归属、合法性、交易税费和权益保障等方面存在显著差异。大产权房是合法且受法律保护的房产，而小产权房则存在法律风险和产权不完整的问题。购房者在选择房产时，应充分了解并权衡这些差异，以保障自身权益。