工程结算审计收费标准通常包括基本审计服务费和审减（增）额审计费两部分。具体收费标准如下：
基本审计服务费
按单项工程总投资额计取，不管有无审减（增）额都的计取，是保底的。
比例：
500万元以下：2‰-3‰
500万元-2000万元：1‰-2‰
2000万元-5000万元：0.5‰-1.2‰
5000万元以上：0.5‰-1.2‰
审减（增）额审计费
按审减（增）额减允许额的余额计取。
比例：
4%-9%
示例计算
假设一个工程总投资额为100万元，审减额为5万元（允许差额为5万元），则收费计算如下：
基本审计服务费：100万元 * 0.0025 = 2500元
审减额审计费：（5万元 - 5万元） * 0.07 = 0元
总收费：2500元
其他注意事项
审计服务时间：
500万元以下：20天
500万元-2000万元：30天
2000万元-5000万元：45天
5000万元以上：60天
审计费用支付：一般由建设方（业主）承担，在工程投资中单独列出
这些标准和计算方法为工程结算审计提供了一个较为清晰的框架，但在实际操作中，审计机构可能会根据具体项目的复杂程度、审计时间和人力成本等因素进行适当调整。建议在选择审计机构时，与审计机构进行充分沟通，明确审计的范围和要求，并协商确定合理的收费标准。