制药企业污水排放标准主要包括以下几个方面：
废水排放标准
制药企业处理后的废水需达到《污水综合排放标准》（GB8978-1996）中的一级标准，具体水质排放指标包括：COD<100mg/L，BOD5<30mg/L，SS<70mg/L，pH值6~9，挥发酚<0.5mg/L，石油类<5mg/L。
总量排放限值
制药工业废水的总量排放限值由国家环保部门规定，企业必须按照环保部门核定的总量进行排放，不得超过规定的排放标准。对于超过排放总量控制要求的企业，环保部门将对其进行处罚，并责令其采取措施进行整改。
特定物质限值
制药工业废水中的特定物质含量，包括药物成分、有毒有害物质、重金属离子等，这些物质会对环境和人类健康造成极大危害。根据相关规定，这些特定物质含量必须低于规定的限值，否则将视为超标排放，面临处罚和整改的要求。
生物性指标
制药工业废水的生物性指标，如大肠菌群数、细菌总数、总大肠菌群等，必须符合国家或地方规定的排放标准，否则将视为超标排放，面临处罚和整改的要求。
其他相关规定
制药企业还需遵守其他相关环保法规和标准，如《制药工业水污染物排放标准（征求意见稿）》中提到的各项排放限值和监控位置，以及中药类、提取类、生物工程类制药工业水污染物排放标准等。
综上所述，制药企业污水排放标准涵盖了废水水质、总量排放、特定物质、生物性指标等多个方面，旨在确保制药企业在生产过程中产生的废水对环境和人类健康的影响降到最低。企业应严格遵守相关法规和标准，采取有效措施进行废水处理，确保排放的废水符合国家和地方的排放标准。