在工程合作协议中，项目合作利润的分成通常遵循以下原则：
平等互利原则 ：甲乙双方在合作中应本着平等互利的原则，确保双方的利益得到合理保障。按投入比例分配：
利润通常按照甲乙双方的投入比例进行分配。投入包括资金、技术、客户资源等。
明确分配比例：
合作双方应在协议中明确约定利润的具体分配比例，并在补充协议中详细规定支付方式和时间。
监督与执行：
甲方有权对乙方的业务操作进行监督，确保其符合法律法规和合同约定，并按照约定时间和方式支付利润分成。
风险共担：
合作项目中的风险通常由双方共同承担，亏损或民事责任也由全体合伙人共同承担。
合同约束：
合作双方应签订正式的合作协议，明确各自的权利与义务，并在遇到争议时通过协商解决。
独立第三方审计：
在利润分配前，应由双方共同认可的独立第三方审计机构对项目的财务进行审计，确保分配的公正性。
其他条款：
协议中还可以包括其他相关条款，如项目固定资产和盈余的分配、企业债务的承担、固定投入的比例等。
合作项目及合作方式
合作项目：工程项目
合作方式：甲方负责提供资金，乙方负责提供业务渠道、客户资源及全程业务操作
利润分配：
利润按照甲乙双方约定的比例进行分配，具体比例在补充协议中约定
甲方应按照约定时间和方式向乙方支付利润分成，具体支付方式和时间在补充协议中约定
双方的权利与义务：
甲方有权对乙方的业务操作进行监督，确保其符合法律法规和合同约定
甲方应按照约定时间和方式向乙方支付利润分成
甲方应按照约定提供本项目所需的资金
乙方有权按照约定进行业务操作，并获取利润分成
乙方应按照约定提供业务渠道、客户资源，并保证其真实性和有效性
建议在签订正式的合作协议前，双方应详细讨论并明确各项条款，必要时可咨询专业律师或法律顾问，以确保协议的合法性和有效性。