落实新发展理念存在的问题主要包括以下几个方面：
形式主义：
一些地方政府和企业在贯彻新发展理念时，存在形式主义现象。他们仅仅停留在表面上的宣传、文件发布和标语悬挂，而缺乏实际行动和创新，导致新发展理念的执行效果不佳。
监督和考核机制不健全：
当前的评价和考核机制主要以GDP增长率为标准，不能全面反映经济、环境和社会的综合效益。这导致企业和地方政府更关注短期经济利益，忽视环境保护、公平与公正等方面的问题。
发展理念顺序不当：
一些地方在建设过程中仍遵循“先建设后保护，先发展后治理”的思路，这与新理念的要求不符。应重视环境保护和文化保护的前置性和支撑性，确保公共利益和生态环境的有效保护。
思想认识和理解不足：
部分地方和单位对新发展理念的理解和认识存在偏差，有些人认为新发展理念仅是新的口号和政策，没有深入理解其核心要义，导致执行工作缺乏力度和效果。
政策执行缺乏可操作性：
一些地方的政策制定滞后，具体执行标准模糊不清，缺乏统一的制度和标准，操作流程不够规范化，执法监管不够严格，导致政策执行效果不佳。
实施过程中存在局限性和难度：
由于各地经济发展水平、产业结构和市场状况存在差异，实施新发展理念面临诸多挑战，如产业结构调整和生态环境优化需要大量时间和资源，同时还需应对人员流动性和社会保障模式的矛盾。
跨部门协作不足：
实现新发展理念的满意成果需要各部门和单位的协作和配合，但实际操作中跨部门协作存在诸多问题，影响了政策的有效执行和落实。
认识误区和行为偏差：
一些地方和单位存在不适应、不适合甚至违背新发展理念的认识、行为和做法，如拼资源拼投入、先污染后治理等片面发展、畸形发展的问题。
理论与实践脱节：
部分干部职工在落实新发展理念时，缺乏责任心和事业心，理论学习不到位，无法将理论应用于实际工作中，导致工作效果不佳。
落实决策部署不到位：
一些地方和部门在贯彻落实上级会议精神和重要安排时，存在简单传达、走个过场的情况，没有进行深入研究和有效督办，导致落实效果不佳。
针对这些问题，需要从加强理论学习、完善监督和考核机制、调整发展理念顺序、提高政策执行的可操作性、加强跨部门协作、纠正认识误区和行为偏差、以及将理论与实践相结合等方面入手，全面、深入地推进新发展理念的落实。