清算程序终结的办理主要包括以下几个步骤：
制作清算报告
清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，应当制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民法院确认。
法院确认
清算组将清算报告报人民法院确认后，人民法院应当裁定终结清算程序。
公告终结
法院经审查确认后，会发布公告，宣告破产清算程序终结。公告内容应包括破产企业的基本情况、清算结果等重要信息，以保障债权人及其他相关方的知情权。
注销登记
管理人应在法院公告终结后，及时到工商行政管理部门等相关机构办理破产企业的注销登记手续，将破产企业从登记在册的企业名单中去除。同时，还需办理税务注销登记。
资料归档
管理人需将破产清算过程中的所有资料进行整理归档，包括各种清算报告、财务报表、法律文书等，以备后续查阅和监督。
财产处置
对于破产清算过程中处置的财产，要按照法律规定进行分配和处理，确保债权人的合法权益得到充分保障。
印章销毁
清算组应当注销清算组账户，将清算组印章交公安机关销毁，并将销毁印章的证明交人民法院备案。
后续处理
清算结束后，公司应当继续存续，但不得开展与清算无关的经营活动。对于在破产清算过程中存在过错的相关人员，如董事、监事等，可能会依据法律规定承担相应的民事责任。
建议在办理清算程序终结时，各相关方应密切配合，严格按照法律程序进行操作，以确保手续的合法性和有效性。