反编译并修改程序通常涉及以下步骤：
选择合适的反编译工具
根据目标软件的类型（如Windows、Linux或Mac）选择合适的反编译工具。常见的反编译工具有IDA Pro、Ghidra、Hopper Disassembler、dnSpy、ILSpy等。
获取目标软件的二进制文件
这通常是软件的执行文件或动态链接库文件。对于Android应用，通常是.apk文件；对于Windows程序，可能是.exe文件或.dll文件。
使用反编译工具进行反编译
将二进制文件转换为源代码格式。例如，使用apktool反编译Android应用，使用IDA Pro反编译Windows可执行文件。
源代码分析
在得到源代码后，仔细分析代码结构、逻辑和算法。这一步对于理解软件功能和找出可修改的部分至关重要。
代码修改与优化
在理解软件工作原理的基础上，根据需求对代码进行修改或优化。这可能包括功能增加、性能提升或错误修复等。
重新编译与测试
完成代码修改后，需要重新编译代码并测试软件的运行情况。确保修改没有引入新的问题，并且软件按预期运行。
具体示例
修改Android应用的“检查更新”功能
使用Apktool反编译
```sh
apktool d YourApp.apk
```
修改资源文件
在反编译后的目录中找到`resources.arsc`文件，并使用Arsc编辑器打开。
搜索关键词“检查更新”，找到其对应的ID，并将其值改为“false”以关闭该功能。
重新编译
```sh
apktool b YourApp
```
重新安装并测试
卸载原来的安装包，重新安装修改过的包，并测试“检查更新”功能是否已关闭。
修改Windows程序的条件调用
使用IDA Pro反编译
打开程序并找到相关函数调用。
修改条件调用
将条件调用（如`BEQ`）改为无条件调用（如`B`）。
重新编译
使用ilasm将修改后的IL代码重新生成DLL文件。
测试
将修改后的DLL替换原程序中的DLL，并运行程序以验证修改是否生效。
注意事项
版权问题：反编译和修改软件可能涉及版权问题，请确保你有合法的权利进行修改。
稳定性：修改后的程序可能不稳定，可能会出现新的问题，务必进行充分的测试。
安全性：反编译和修改软件可能会引入安全漏洞，请确保你的修改不会导致安全问题。
通过以上步骤，你可以成功地反编译并修改程序。请根据具体需求和目标软件的特点选择合适的工具和方法。