项目签证程序通常包括以下几个步骤：
提出签证申请
施工单位根据《招标文件》、《施工合同》、《设计变更通知（指令）单》完成变更工程的施工，并经过监理单位验收通过后，提出工程签证申请。
工程签证由承包人的项目经理依据相关变更事项向项目监理部提出，同时提交“工程变更签证单”及签证依据，返工重做的应有现场实体照片。
审核签证申请
项目监理部收到“工程变更签证单”后，应对该单的依据、实物工作量、完成质量是否符合合同及有关规定进行核查，然后提交工程部复核。
工程部逐级复核，专业工程师对经监理核查认可的“工程变更签证单”和内容进行复核，并签署看法。
成本部对该项“工程变更签证单”的书面依据及单价、金额是否符合合同、国家的有关规定及市场的实际水平进行审查，签署看法后提交总经理（或工程主管）批准。
现场核实
涉及工程量变化的签证，由内部审核人员、现场代表实地查看后，由基建处处长签发。
签证单据应包含工程名称、分部分项工程名称、签证编号、签证原因、签证工程量、施工方法简述或图集号、施工单位、监理单位、建设单位签字盖章、日期等要素。
审批与签发
确属无法计算量且人工数较大的，一次签证不超过1200元/次的签证，由工程科科长签发；超过1200元/次的签证及累计签证费用超过6000元时，签证均需基建处处长同意才能签发。
总经理（或工程主管）负责“工程变更签证单”的批准。
登记与备案
签证单用统一表格，一式四份，原件交基建档案员登记备案，监理、施工企业、内部审核人员人手一份，签证单必须由有关人员签字并加盖基建处章，否则无效。
结算与备案
工后按照确认意见结算，签证单据应详细注明工程名称、专业签证原因以及工程的详细内容，同时应附预算书，必要时应附工程委托单。
以上步骤确保签证过程规范、透明，并且符合相关法律法规的要求。建议在实际操作过程中，各方应严格按照程序执行，以确保签证的有效性和合法性。