微信小程序流量主的结账流程如下：
结算周期
微信小程序广告流量主的结算规则是每半个月结算一次，具体为次月1号和次月15号前（如遇法定节假日，将会推迟）。
结算内容
结算单包含了同一收款主体在微信开通的全部流量主账号在当月应获取的广告收入。
结算方式
个人用户：无需邮寄发票，腾讯公司将在结算日后15个工作日内根据结算金额为您代扣代缴个税，并接受税务局委托，为您代征增值税和附加税费，最终将剩余金额打入流量主的结算银行卡。
企业用户：需要按结算单邮件的要求邮寄与结算金额等额的增值税专用发票给腾讯公司。腾讯公司将在收到正确的发票及结算单后30个工作日内将结算金额打入流量主的结算银行账户。
结算前准备
流量主在开通后需要立即补充财务资料，否则会影响结算。财务资料包括银行账户信息等，具体操作路径为：小程序管理后台 -> 广告与服务 -> 流量主 -> 财务管理 -> 立即完善。
结算单核对与修改
流量主需要核对结算单中的税率、收款账户、退件地址等信息，如结算单内容有误，可以根据提示进行修改，并重新生成对应月份的结算单。
电子发票
法人可以绑定流量主财务助手，查看结算进度和收入，并可以上传电子发票。上传电子发票后，可以在记录中查看状态，通常在10~15天内完成支付。
账户变更
如果流量主需要变更结算账户，可以登录小程序，在流量主页面 -> 财务管理 -> 结算数据 -> 结算信息中提交变更申请，并留意审核结果。
总结：
微信小程序流量主的结账流程清晰明了，个人用户和企业用户需按照不同要求操作。建议流量主在开通后及时完善财务资料，确保结算过程顺畅。