防止.NET程序被反编译可以采取以下措施：
代码混淆
深度混淆：通过第三方加密服务进行代码深度混淆，使得反编译后的代码难以理解。
自定义混淆：在项目设置中开启反汇编，并使用混淆工具如ConfuserEx进行自定义混淆。
强名称签名
对程序集进行强名称签名，可以确保程序集的来源和完整性，防止被篡改。
本地编码
将核心算法和敏感逻辑用非托管代码实现，增加反编译难度。
加密与解密
对关键数据和敏感信息进行加密，运行时再解密，以减少直接存储明文数据的风险。
组件加壳
使用加壳工具将.NET程序封装在一个外壳中，使反编译工具难以直接接触到原始的IL代码。
动态库嵌入加密
将依赖的动态库加密后嵌入程序集中，运行时解密加载，提高逆向工程的难度。
硬件狗
使用硬件狗等物理设备来存储加密密钥，使得即使在软件层面被破解，也因缺少硬件狗而无法运行。
定期更新
定期更新程序，更改核心算法和逻辑，即使被反编译，也需重新进行逆向工程。
使用加密工具
公司购买使用的一款.Net加密工具是VirboxProtector，对.NET的保护方式主要有：JIT加密、智能压缩、代码加密、代码混淆、名称混淆、去除强签名等。
了解反编译技术
在采取保护措施之前，了解反编译技术的工作原理是很有帮助的，这有助于采取更有针对性的保护措施。
通过综合运用上述方法，可以显著提高.NET程序的安全性，降低被反编译的风险。