针对您的问题“小程序源码不同怎么设置”，以下是几种可能的解决方案：
使用持续集成（CI）工具
可以通过微信开发者工具的CI功能来实现多个小程序的发布和更新。具体做法是创建两个项目，每次代码同步一致，并通过CI工具自动部署到不同的环境中。
服务商模式
通过服务商模式，可以为不同的客户提供定制化的小程序服务。在这种模式下，可以为每个客户创建独立的项目，配置不同的接口地址，从而实现多个小程序的发布和管理。
模板开发与定制开发
模板开发：选择一个小程序类别和模板，然后进行后台编辑。模板的源码归属于模板开发公司，用户只能修改模板内容，不能获取完整的源码。
定制开发：用户可以选择定制开发，拥有完整的源码所属权，数据可以由自己控制。定制开发费用较高，但后续升级和维护可以自主进行。
使用第三方平台
市面上有第三方平台提供小程序的搭建服务，通常包括SaaS系统和独立系统。SaaS系统提供前端搭建部署，但通常不提供源代码；独立系统则提供全套源代码，便于企业自行开发和维护。
建议
对于需要频繁更新和不同配置的小程序，建议使用CI工具或服务商模式，这样可以高效地管理和发布多个小程序。
对于需要完全控制源码和数据的定制开发，建议选择定制开发，虽然初期成本较高，但长期来看可以节省维护成本。
如果希望快速搭建小程序且预算有限，可以考虑使用模板开发，但需注意源码归属和修改限制。
希望这些建议对您有所帮助!