小程序假冒店铺的处罚措施主要包括以下几种情形：
情节轻微
信用分扣除3分
店铺停业整顿
情节严重
店铺清退
信用分扣除12分
扣除全部保证金
永不合作
情节特别严重
店铺清退
信用分扣除12分
限制店铺结算
限制提现
扣除全部保证金及违规所得货款
永不合作
此外，根据《消费者权益保护法》，如果涉嫌欺诈，消费者可要求卖家退货并赔偿损失；如卖家明确告知买家所售商品为假货，其行为虽不构成欺诈，但其在未经商标权人许可的情况下使用其注册商标，涉嫌侵犯他人商标权，商标权人可以要求行为人停止侵害赔偿损失。销售金额较大还可能涉嫌销售假冒注册商标的商品罪，根据《刑法》第二百一十四条，销售明知是假冒注册商标的商品，销售金额数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；销售金额数额巨大的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
建议小程序开发者严格遵守相关规定，避免从事假冒店铺的行为，以免受到严厉处罚。