微信小程序的认证交费方式如下：
商家缴纳
商家可以通过平台向小程序账号管理员的微信下发支付通知模板消息，同时返回支付地址。
管理员可以直接把支付地址或者把地址封装成二维码后发给管理员，管理员需在24小时内完成支付。
服务商代缴
选择服务商代缴的话，将扣除服务商对应类型认证代缴服务额度，并同步流转至认证审核。
支付审核服务费用
微信小程序认证主要有两种方式：支付验证与微信认证。除政府或部分组织（基金会、外国政府机构驻华办事处）可免费申请外，其他类型申请微信认证均需支付审核服务费用。这是用户基于腾讯提供的资质审核服务而支付的一次性费用，用户每申请一次认证服务需要支付一次审核服务费。无论认证成功或失败，都需要支付审核服务费。每年需审核一次。
填写发票信息
在支付认证审核费用后，需要填写发票信息，包括纳税识别号（营业执照上的统一社会信用代码）。审核费用为300元。
其他注意事项
认证通过后，需要填写小程序信息和小程序类目。小程序信息包括小程序名称、简称、头像及小程序介绍，小程序类目需要根据小程序服务内容结合开发服务类目链接进行添加。
某些情况下，例如已有认证过的公众号，可以通过特定渠道免交300元认证费用，但这种方法并不适用于所有人。
建议选择商家缴纳或服务商代缴的方式，以确保认证过程顺畅并按时完成支付。