实施实质性程序主要包括以下步骤：
了解与评估重大错报风险
注册会计师需要了解被审计单位的业务、风险和控制环境，评估可能存在的重大错报风险。
针对评估的风险，设计和实施相应的实质性程序。
设计实质性程序
实质性程序包括细节测试和实质性分析程序。细节测试是对交易、账户余额和列报的具体细节进行测试，以直接识别错报。实质性分析程序则是通过研究数据间的关系来评价信息，识别错报。
对于特别风险，应当专门设计和实施实质性程序，可能包括细节测试或将细节测试与实质性分析程序结合使用。
实施实质性程序
在控制测试的基础上进行实质性程序，根据控制测试的结果决定实质性程序的繁简程度。
针对特别风险，可能需要实施额外的审计程序，如扩大函证范围、询问非财务人员等。
在实施实质性程序时，注册会计师应根据具体情况确定是否仅实施实质性分析程序、仅实施细节测试，还是将两者结合使用。
获取审计证据
通过实质性程序获取充分、适当的审计证据，以支持审计结论。
实质性程序提供的证据通常是直接证据，有助于揭示财务报表中的错报。
记录与报告
记录实施的实质性程序及其结果，包括测试的控制、获取的审计证据和得出的结论。
如果发现需要向被审计单位报告的事项，应及时更新相关记录。
评价与修正
根据实质性程序的结果，评价被审计单位的风险评估和控制措施的有效性。
如果发现控制不可信赖，需要修正进一步的审计程序，如测试替代性控制或实施额外的实质性程序。
通过以上步骤，注册会计师可以有效地实施实质性程序，发现财务报表中可能存在的重大错报，从而确保审计质量。