单个程序加密的方法有多种，以下是一些常见的方法：
使用系统内置加密功能
Windows：可以使用BitLocker驱动器加密为整个硬盘或特定分区提供加密保护。
macOS：可以使用FileVault为整个磁盘提供加密保护。
利用第三方加密软件
域智盾软件：提供透明加密技术、文件外发管控、剪贴板和防拖拽保护等功能，支持多种应用程序和文件格式的加密。
文件夹加密超级大师：专业的文件加密软件，可以加密文件和文件夹，使用密码保护。
虚拟化技术加密
使用虚拟化技术（如VMware或VirtualBox）创建虚拟环境，将应用程序运行在隔离的虚拟机中，并通过为虚拟机设置访问密码或启用加密存储来保护应用程序安全。
编程实现自定义加密
可以使用编程语言（如Python）和加密库（如cryptography）来实现自定义加密算法，对程序中的数据进行加密和解密。
在C程序中，可以使用System.Security.Cryptography命名空间提供的加密算法（如AES、DES和RSA）来加密和解密数据。
软件加壳和打包工具
使用加壳工具（如PEConvert）和打包工具（如NSIS）对程序进行加壳和打包，以增加反病毒软件的检测和破解难度。
加壳和打包工具
使用加壳工具（如PEConvert）和打包工具（如NSIS）对程序进行加壳和打包，以增加反病毒软件的检测和破解难度。
硬件加密
通过添加外部硬件电路或使用具有唯一标识码的MCU（如STM32）来实现硬件级别的加密保护。
建议
选择合适的加密方法：根据具体需求选择合适的加密方法，例如，如果需要全盘加密，可以考虑使用系统内置的BitLocker功能；如果需要针对特定应用程序进行加密，可以选择第三方加密软件或编程实现自定义加密。
定期更新密钥：无论使用哪种加密方法，都应定期更新密钥以防止破解。
备份重要数据：在加密前务必备份重要数据，以防加密过程中出现意外情况导致数据丢失。
通过上述方法，可以有效地对单个程序进行加密，保护数据安全。